Videó: Hogyan szerelik össze a kontigokat állványokká?
2024 Szerző: Miles Stephen | [email protected]. Utoljára módosítva: 2023-12-15 23:37
A genomvázlat létrehozásakor a DNS egyedi leolvasása az első kontigokba összerakva , amelyek természetüknél fogva összeszerelés , hézagok vannak közöttük. A következő lépés az nak nek majd áthidalja a szakadékokat ezek között összefügg hozzon létre egy állvány . Ez megtehető optikai leképezéssel vagy társ-pár szekvenálás segítségével.
Hasonlóképpen felteheti a kérdést: mik azok a kontigok és állványok?
A állvány a genomszekvencia egy része, amelyet a végszekvenciájú, teljes genomot tartalmazó shotgun klónokból rekonstruáltak. Állványok -ből állnak kontigok és hézagok. A contig A genomiális szekvencia összefüggő hossza, amelyben a bázisok sorrendje nagy megbízhatósági szinten ismert. Egyes esetekben, állványok átfedhetik egymást.
Illetve mi a kontig a bioinformatikában? A contig (az összefüggőből) átfedő DNS-szegmensek halmaza, amelyek együtt a DNS konszenzus régióját képviselik. Contigs így átfedő DNS-szekvenciára és a klónokban található átfedő fizikai szegmensekre (fragmensekre) vonatkozhat a kontextustól függően.
Ebben a tekintetben hogyan szerelik össze a kontigokat?
A DNS-fragmensek átfedő DNS-szekvenciájának halmazát a contig . Contig A leképezés egy olyan folyamat, amelynek során átfedő klónok összeszerelve az átfedés sorrendjét. Ez magában foglalja a kontigok sorrendben és tájolásban. Klón kontigok automatikusan lehet összeszerelve BAC-végi szekvenciáikat használva.
Miért fontosak a kontigok?
Contig összeszerelés egy fontos lépés a genom összeállításban. A feltérképezéshez az átfedő klónokat olyan szekvenciákba állítják össze, amelyek átfednek. Mindegyik fragmenst egy vektorba klónozzuk, és mindkét végéről szekvenálják, hogy körülbelül 600–700 bp hosszúságú szekvenciát kapjunk. A DNS-fragmens mindkét végéből származó szekvenciát párvégnek nevezzük.
Ajánlott:
Hogyan függenek össze a termodinamika és az entrópia törvényei?
Az entrópia a munkavégzéshez rendelkezésre álló energia elvesztése. A termodinamika második főtételének egy másik formája azt állítja, hogy egy rendszer teljes entrópiája vagy növekszik, vagy állandó marad; soha nem csökken. Reverzibilis folyamatban az entrópia nulla; visszafordíthatatlan folyamatban növekszik
Hogyan függ össze a kiszáradás és a hidrolízis?
Ennek egyik módja két fontos reakció, az úgynevezett dehidratáció és hidrolízis. A dehidratációs reakciók a monomereket polimerekké kapcsolják össze víz felszabadulásával, a hidrolízis pedig egy vízmolekula segítségével monomerekké bontja a polimereket. A monomerek csak egyetlen egységmolekulák, a polimerek pedig monomerek láncai
Hogyan függ össze egy csillag hőmérséklete és színe?
A csillag hőmérséklete a felszínére utal, és ez határozza meg a színét. A legalacsonyabb hőmérsékletű csillagok vörösek, míg a legforróbb csillagok kékek. A csillagászok meg tudják mérni a csillagok felületének hőmérsékletét, ha spektrumukat egy fekete test spektrumához hasonlítják
Hogyan nézett ki a DNS, és a kémiai szerkezete összefügg azzal, hogy hogyan néz ki, amikor sok csomó össze van csomózva?
Kapcsolja össze a kémiai szerkezetét azzal, hogy hogyan néz ki, amikor sok csomó össze van csomózva. A DNS pókhálónak tűnt. A DNS oldható volt a DNS extrakciós pufferben, így nem láthattuk. Amikor belekeverték az etanolba, összetapadt, és egyre vastagabb szálakat képezett, amelyek elég nagyok voltak ahhoz, hogy láthassák
Hogyan szerelik fel az iszapkerítést?
Tekerje és tűzze fel az iszapkerítést a karók köré. Tekerje le az iszapos kerítésszövetet, és tekerje át a karókon úgy, hogy az anyag alja az árokban feküdjön. Miközben az iszapos kerítést a karók egyik oldalára tekeri, tűző- vagy kalapácspisztollyal rögzítse az anyagot a karókhoz